Za srpsku javnost, svakako je najzanimljivije istraživanje ovog novinara u vezi sa ubistvom premijera Srbije Zorana Đinđića, 2003. godine. Margetić tvrdi da je Đinđić bio žrtva namere albanske mafije, ali i političara da stvore nezavisno Kosovo.
- Albanski političari na čelu sa Hašimom Tačijem i predstavnici porodice Osmani održali su tajni sastanak na kome je dogovorena operacija "Dureš", odnosno dalja strategija u nameri da albanska mafija do sticanja nezavisnosti Kosova preuzme potpunu kontrolu na Balkanu.
Nemačka BND je o tome 2005. godine sačinila i opsežnu istragu, ponudila dokaze, ali tada to u Evropi nikoga nije interesovalo. Da je Zoran Đinđić ostao živ, Albanci ne bi dobili nezavisnost, a porodica Osmani ne bi došla do cilja - kategoričan je Domagoj Margitić i povezuje ubistvo Đinđića sa Pukanićem.
- Dokumenti koje su mi dali visokopozicionirani službenici hrvatskih obaveštajnih službi, dokazuju kako su ubistva Đinđića i Pukanića dva povezana slučaja. Obojica su žrtve kriminalnog biznisa koji se meri milijardama evra - kaže Margetić.
Reč je o kartelu koji je apsolutno preuzeo kontrolu nad ostalim kriminalnim grupama i u Srbiji, Hrvatskoj, Crnoj Gori i oko prodaje heroina i belog roblja i oružja na Balkanu - kaže Margetić koji je na osnovu svih dokumenata do kojih je došao napisao knjigu: "Slučaj Pukanić: Ubistvo sa potpisom države" koja će se u prodaji naći sredinom ovog meseca.
Margetić navodi da se iz jednog od dokumenata hrvatske Bezbednosno obaveštajne agencije (SOA), nedvosmisleno vidi da su zvaničnici Hrvatske znali da se priprema ubistvo Ive Pukanića.
- Sadašnji ministar policije Tomislav Karamarko je na vreme dobio službenu belešku hrvatskih obaveštajnih službi u kojoj se navodi ko sve iz klana Osmani priprema likvidaciju Pukanića, ali ni on ni bilo ko drugi nije preduzeo ništa - tvrdi Margetić.